6月21日，施工人員對共和國科學第一樓原子能樓進行拆除。截至當日17時，該樓北面主體局部已基本被拆除。

20日，科技日報推出《京城之大，能容得下小小的原子能樓嗎?等報道，呼吁維護有可能被拆除的共和國科學第一樓。孰料21日早上，施工人員開始撤除此樓。

記者21日上午聞訊趕到現場發現，原子能樓的東面配樓已拆得所剩無幾，整個大樓已拆近三分之一。大樓南面主體局部和西配樓還未拆除。幾臺黃色大型挖掘機正在施工。

大樓北面已被藍色的隔離板圍起來，外人不得入內。當記者前去探問此樓是否要拆時，門衛給出肯定答案后，將記者關在門外。通過欄桿縫隙，記者找到幾個正在吃飯的施工人員了解情況。說，21日早上接到通知來拆除此樓，預計半個月后將完成所有撤除工作。記者又從一小道混入大樓南面拍照，被一保安發現并制止。表示不讓外人進入，不允許拍照。

此樓的南面是國家納米科學中心。原子能樓拆除后我將建設一個新的科研大樓，但領導討論的方案是保管一面墻。路過的納米中心研究人員說。

下午17時，施工現場有人爆料，16時30分左右撤除工作因故被緊急叫?！，F場拍攝照片顯示，該樓北面主體局部已基本被拆除。

記者打通中科院相關領導電話詢問此事，對方均稱不分管或不了解此事，讓聯系中科院傳達局。記者打通傳達局電話，一位工作人員說不清楚情況，讓記者走采訪程序，會逐級請示。一位領導稱，此事很敏感”下午院領導已就此事召開臨時會議。納米中心領導也一直未接電話。

1953年建成的原子能樓是中關村的第一座現代化科研設施，也稱共和國科學第一樓。從這里走出兩位國家最高科學技術獎獲得者，6位“兩彈一星功勛獎章”獲得者，數十位泰斗級院士，裂變”出一批重要的核科學和物理學研究機構。中科院院史研究室原主任樊洪業認為，該樓具有不可再生的歷史文物價值。

近一年來，一些老科學家多方呼吁保管此樓。曾在此工作的葉銘漢院士說，中科院也就該樓的維護方案進行過多次論證，并征求過他意見。記者了解到中科院曾討論過原子能樓整體和部分保留的可行性?？扇魧⒃幽軜亲鳛榧o念設施改造或整體移動，申報難度大，審批許可周期也將非常長，影響納米中心新建項目的進度。

一位不愿具名的中科院相關負責同志透露，該樓撤除手續齊全完整，但是該樓有獨特的歷史價值，院辦也多次開會研究其保護方案?，F在方案是將老樓拆除，但將保管一面南墻并嵌入新樓，同時保管老樓中加速器這一重要設備。